Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 HTS1YPR033C 1641 nt6.87□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 YCR025CYCR025C 411 nt6.86□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 SER2YGR208W 930 nt6.86□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 YMR206WYMR206W 942 nt6.86□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 CDC3YLR314C 1563 nt6.86□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 CMK2YOL016C 1344 nt6.85□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 TRR1YDR353W 960 nt6.85□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 YPR084WYPR084W 1371 nt6.84□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 BAP3YDR046C 1815 nt6.84□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 AFG3YER017C 2286 nt6.84□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 MSB3YNL293W 1902 nt6.84□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.83□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.83□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.83□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.83□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.83□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 HHY1YEL059W 309 nt6.82□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 OPI1YHL020C 1215 nt6.82□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 SEN2YLR105C 1134 nt6.82□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 RPS6AYPL090C 711 nt6.82□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 RPS6BYBR181C 711 nt6.82□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 STE3YKL178C 1413 nt6.81□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.8□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 EXG2YDR261C 1689 nt6.8□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 HEL1YKR017C 1656 nt6.8□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 KIN1YDR122W 3195 nt6.79□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 YOR389WYOR389W 1875 nt6.79□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 CDC13YDL220C 2775 nt6.79□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 GET2YER083C 858 nt6.79□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 INP54YOL065C 1155 nt6.79□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 PUS7YOR243C 2031 nt6.78□□□□□ -1.32
NEJ1Q06148 SEC23YPR181C 2307 nt6.77□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 SMC5YOL034W 3282 nt6.77□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 YER156CYER156C 1017 nt6.77□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 YJL064WYJL064W 396 nt6.77□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 MEU1YLR017W 1014 nt6.77□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 FCY1YPR062W 477 nt6.77□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 YNL295WYNL295W 1575 nt6.77□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 SSC1YJR045C 1965 nt6.77□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 EFM1YHL039W 1758 nt6.76□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 RQC1YDR333C 2172 nt6.76□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 BDS1YOL164W 1941 nt6.76□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 ATP2YJR121W 1536 nt6.76□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 YCR061WYCR061W 1896 nt6.75□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 PET18YCR020C 648 nt6.75□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 ADH6YMR318C 1083 nt6.75□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 PAU19YMR325W 375 nt6.75□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 NUP84YDL116W 2181 nt6.74□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 ICL2YPR006C 1728 nt6.74□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 MCH2YKL221W 1422 nt6.74□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 MHP1YJL042W 4197 nt6.73□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 RRP43YCR035C 1185 nt6.73□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 MTR3YGR158C 753 nt6.73□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 CYB2YML054C 1776 nt6.72□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 EDC3YEL015W 1656 nt6.72□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 SNT309YPR101W 528 nt6.72□□□□□ -1.33
NEJ1Q06148 SUN4YNL066W 1263 nt6.71□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 ARC35YNR035C 1029 nt6.71□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 YPT10YBR264C 600 nt6.71□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 RRN10YBL025W 438 nt6.7□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 CRN1YLR429W 1956 nt6.69□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 NTG1YAL015C 1200 nt6.69□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 CDC7YDL017W 1524 nt6.69□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 RDR1YOR380W 1641 nt6.68□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 YIL168WYIL168W 384 nt6.68□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 SPS1YDR523C 1473 nt6.67□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 AMN1YBR158W 1650 nt6.67□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 PSA1YDL055C 1086 nt6.66□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 YJL160CYJL160C 864 nt6.66□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 MFT1YML062C 1179 nt6.66□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 DSC3YOR223W 879 nt6.66□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 PHO85YPL031C 918 nt6.66□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 TAH11YJR046W 1815 nt6.66□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 TDP1YBR223C 1635 nt6.65□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.65□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 RPL2BYIL018W 765 nt6.65□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 YMR074CYMR074C 438 nt6.65□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 SMK1YPR054W 1167 nt6.65□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 YPR127WYPR127W 1038 nt6.65□□□□□ -1.34
NEJ1Q06148 ERS1YCR075C 783 nt6.64□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 YCP4YCR004C 744 nt6.63□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 ECM27YJR106W 2178 nt6.63□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 PGI1YBR196C 1665 nt6.63□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 GSH1YJL101C 2037 nt6.61□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 SPR1YOR190W 1338 nt6.61□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 PUP1YOR157C 786 nt6.61□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 RPL43AYPR043W 279 nt6.61□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 AGP2YBR132C 1791 nt6.6□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 MIX17YMR002W 471 nt6.6□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 HBN1YCL026C-B 582 nt6.6□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 YBR241CYBR241C 1467 nt6.6□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 CEM1YER061C 1329 nt6.59□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 CCT3YJL014W 1605 nt6.59□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 YAL045CYAL045C 309 nt6.59□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 OPI11YPR044C 354 nt6.59□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 TOS2YGR221C 1869 nt6.59□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 GPH1YPR160W 2709 nt6.59□□□□□ -1.35
NEJ1Q06148 IRC5YFR038W 2562 nt6.59□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 SKP1YDR328C 585 nt6.58□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 MRPL28YDR462W 444 nt6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.2 ms