Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN1Q05586 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN1Q05586 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN1Q05586 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN1Q05586 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms