Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.68□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.68□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.68□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 SRM1YGL097W 1449 nt8.67□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 OPI1YHL020C 1215 nt8.67□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 YPL136WYPL136W 369 nt8.67□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 GNP1YDR508C 1992 nt8.66□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 YPQ2YDR352W 954 nt8.66□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 OPI7YDR360W 435 nt8.66□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 AIM20YIL158W 615 nt8.66□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 TUB1YML085C 1344 nt8.65□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 ALR1YOL130W 2580 nt8.64□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 CCW12YLR110C 402 nt8.64□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 YOL046CYOL046C 675 nt8.64□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 YOR072WYOR072W 315 nt8.64□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 FIT1YDR534C 1587 nt8.64□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 GPD1YDL022W 1176 nt8.63□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 HOC1YJR075W 1191 nt8.63□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 CDA1YLR307W 906 nt8.63□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 ERV25YML012W 636 nt8.63□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 YCL049CYCL049C 939 nt8.63□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 BDS1YOL164W 1941 nt8.62□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 YJL213WYJL213W 996 nt8.62□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 NME1NME1 340 nt8.62□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 ERR3YMR323W 1314 nt8.61□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 MRPL35YDR322W 1104 nt8.61□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 LIA1YJR070C 978 nt8.61□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 GET4YOR164C 939 nt8.61□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 NBA1YOL070C 1506 nt8.6□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 PEX28YHR150W 1740 nt8.6□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 YPR076WYPR076W 375 nt8.59□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 YJL163CYJL163C 1668 nt8.59□□□□□ -1.03
SYF1Q04048 CIA1YDR267C 993 nt8.58□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 AVO2YMR068W 1281 nt8.58□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 CIT2YCR005C 1383 nt8.58□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 SCS22YBL091C-A 528 nt8.57□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt8.57□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 MEX67YPL169C 1800 nt8.57□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 MPE1YKL059C 1326 nt8.55□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 YDR215CYDR215C 414 nt8.55□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 MDH1YKL085W 1005 nt8.55□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 YKL153WYKL153W 510 nt8.55□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 PET10YKR046C 852 nt8.55□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 SSC1YJR045C 1965 nt8.54□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 COX15YER141W 1461 nt8.54□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 FTH1YBR207W 1398 nt8.54□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 RTC4YNL254C 1206 nt8.53□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 TPO1YLL028W 1761 nt8.53□□□□□ -1.04
SYF1Q04048 AGX1YFL030W 1158 nt8.52□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 IMD1YAR073W 1212 nt8.51□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 MET13YGL125W 1803 nt8.51□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 PPH21YDL134C 1110 nt8.5□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 ORT1YOR130C 879 nt8.5□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 YIL177CYIL177C 5277 nt8.49□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 YLR030WYLR030W 792 nt8.49□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 PLB2YMR006C 2121 nt8.49□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 FIT2YOR382W 462 nt8.49□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 AVL9YLR114C 2295 nt8.49□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 TOM71YHR117W 1920 nt8.48□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 IMG1YCR046C 510 nt8.48□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt8.48□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 VPS65YLR322W 315 nt8.48□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 CAR2YLR438W 1275 nt8.48□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 PET117YER058W 324 nt8.47□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 MRPL19YNL185C 477 nt8.47□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 HTZ1YOL012C 405 nt8.47□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 LPD1YFL018C 1500 nt8.47□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 FMP40YPL222W 2067 nt8.46□□□□□ -1.05
SYF1Q04048 ILV6YCL009C 930 nt8.46□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 PAB1YER165W 1734 nt8.46□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 FRA1YLL029W 2250 nt8.45□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 UFD1YGR048W 1086 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 YNR005CYNR005C 405 nt8.44□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 RPL2AYFR031C-A 765 nt8.43□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 CKB1YGL019W 837 nt8.43□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 LCL3YGL085W 825 nt8.43□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 RPL2BYIL018W 765 nt8.43□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 QRI5YLR204W 336 nt8.43□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 ASR1YPR093C 867 nt8.42□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 RBS1YDL189W 1374 nt8.41□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 RCF2YNR018W 675 nt8.41□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 BRN1YBL097W 2265 nt8.4□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 FYV1YDR024W 486 nt8.4□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt8.4□□□□□ -1.06
SYF1Q04048 YBL112CYBL112C 318 nt8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.9 ms