Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 PET18YCR020C 648 nt7.4□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 TRP1YDR007W 675 nt7.4□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 RPN14YGL004C 1254 nt7.4□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 FZF1YGL254W 900 nt7.4□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 YBR226CYBR226C 411 nt7.4□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 VBA3YCL069W 1377 nt7.4□□□□□ -1.22
SRP1Q02821 YLL058WYLL058W 1728 nt7.39□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 MPA43YNL249C 1629 nt7.39□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 MPC1YGL080W 393 nt7.39□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt7.39□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 HAP5YOR358W 729 nt7.39□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 KEL3YPL263C 1956 nt7.39□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 LEU4YNL104C 1860 nt7.38□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 NDJ1YOL104C 1059 nt7.38□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 ATF1YOR377W 1578 nt7.37□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 SVF1YDR346C 1446 nt7.37□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.37□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.37□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.37□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.37□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.37□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.37□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.37□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 RAI1YGL246C 1164 nt7.37□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 HMS2YJR147W 1077 nt7.37□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 REX2YLR059C 810 nt7.37□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 CDC13YDL220C 2775 nt7.37□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 ELP3YPL086C 1674 nt7.36□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 YBL070CYBL070C 321 nt7.36□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 YFR006WYFR006W 1608 nt7.36□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 SUA5YGL169W 1281 nt7.35□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 PRE5YMR314W 705 nt7.35□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 SDH8YBR269C 417 nt7.35□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 NSE5YML023C 1671 nt7.35□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 MKK1YOR231W 1527 nt7.34□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 TAD2YJL035C 753 nt7.34□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 RSA3YLR221C 663 nt7.34□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 snR31snR31 225 nt7.34□□□□□ -1.23
SRP1Q02821 TGL5YOR081C 2250 nt7.33□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 MFT1YML062C 1179 nt7.33□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 PEX12YMR026C 1200 nt7.33□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 TOP3YLR234W 1971 nt7.33□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 ADA2YDR448W 1305 nt7.32□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 YER152CYER152C 1332 nt7.32□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 YDR467CYDR467C 327 nt7.32□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 QCR6YFR033C 444 nt7.32□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 KAE1YKR038C 1161 nt7.32□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 YMR166CYMR166C 1107 nt7.32□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 SWT21YNL187W 1074 nt7.32□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 YPT11YNL304W 1254 nt7.32□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 MRI1YPR118W 1236 nt7.32□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 YBR138CYBR138C 1575 nt7.32□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 HXT11YOL156W 1704 nt7.32□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 YFR020WYFR020W 699 nt7.31□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 Q0144Q0144 330 nt7.31□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 YMR114CYMR114C 1107 nt7.31□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 MAS2YHR024C 1449 nt7.3□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.3□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.3□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 PTC7YHR076W 1032 nt7.3□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 ERP5YHR110W 639 nt7.3□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 ISY1YJR050W 708 nt7.3□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 ORT1YOR130C 879 nt7.3□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 NPP2YEL016C 1482 nt7.3□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 POX1YGL205W 2247 nt7.29□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 CDC16YKL022C 2523 nt7.29□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 CRC1YOR100C 984 nt7.29□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 LSP1YPL004C 1026 nt7.29□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 SRP54YPR088C 1626 nt7.29□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 PRB1YEL060C 1908 nt7.29□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 ATO2YNR002C 849 nt7.28□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 ENP1YBR247C 1452 nt7.28□□□□□ -1.24
SRP1Q02821 DIT1YDR403W 1611 nt7.27□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 BUD9YGR041W 1644 nt7.27□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 YDR401WYDR401W 564 nt7.27□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.27□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 RSM7YJR113C 744 nt7.27□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 YPL247CYPL247C 1572 nt7.27□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 ADE16YLR028C 1776 nt7.26□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 RRT14YIL127C 621 nt7.26□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 YJR115WYJR115W 510 nt7.26□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 YNL017CYNL017C 339 nt7.26□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 snR4snR4 186 nt7.26□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 ISR1YPR106W 1332 nt7.26□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 FCP1YMR277W 2199 nt7.25□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 ELP4YPL101W 1371 nt7.25□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 YER156CYER156C 1017 nt7.25□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 GPM1YKL152C 744 nt7.25□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 FUS3YBL016W 1062 nt7.25□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 AIM34YMR003W 597 nt7.25□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 snR34snR34 203 nt7.25□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 TRP2YER090W 1524 nt7.25□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 ACO1YLR304C 2337 nt7.24□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 YBL095WYBL095W 813 nt7.24□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 SRM1YGL097W 1449 nt7.24□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 GDA1YEL042W 1557 nt7.23□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 KGD2YDR148C 1392 nt7.22□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 HXT15YDL245C 1704 nt7.22□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 HXT16YJR158W 1704 nt7.22□□□□□ -1.25
SRP1Q02821 VBA5YKR105C 1749 nt7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.9 ms