Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TFAP4Q01664 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TFAP4Q01664 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TFAP4Q01664 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TFAP4Q01664 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms