Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK17Q00537 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK17Q00537 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK17Q00537 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK17Q00537 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms