Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MRPS9P82933 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRPS9P82933 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MRPS9P82933 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MRPS9P82933 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms