Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL8P80075 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL8P80075 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL8P80075 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL8P80075 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL8P80075 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL8P80075 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL8P80075 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL8P80075 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL8P80075 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL8P80075 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL8P80075 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL8P80075 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL8P80075 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL8P80075 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL8P80075 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL8P80075 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL8P80075 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL8P80075 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL8P80075 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL8P80075 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL8P80075 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL8P80075 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL8P80075 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL8P80075 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL8P80075 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL8P80075 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL8P80075 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL8P80075 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL8P80075 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL8P80075 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL8P80075 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL8P80075 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL8P80075 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL8P80075 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL8P80075 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL8P80075 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL8P80075 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL8P80075 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL8P80075 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL8P80075 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL8P80075 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL8P80075 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL8P80075 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL8P80075 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL8P80075 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL8P80075 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL8P80075 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL8P80075 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL8P80075 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL8P80075 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL8P80075 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL8P80075 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL8P80075 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL8P80075 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL8P80075 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL8P80075 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL8P80075 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL8P80075 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL8P80075 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL8P80075 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL8P80075 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL8P80075 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL8P80075 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL8P80075 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL8P80075 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCL8P80075 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL8P80075 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL8P80075 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL8P80075 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL8P80075 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL8P80075 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL8P80075 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL8P80075 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL8P80075 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL8P80075 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL8P80075 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL8P80075 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL8P80075 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCL8P80075 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL8P80075 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL8P80075 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL8P80075 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL8P80075 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL8P80075 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL8P80075 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL8P80075 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL8P80075 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL8P80075 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL8P80075 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL8P80075 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL8P80075 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL8P80075 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL8P80075 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL8P80075 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL8P80075 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCL8P80075 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL8P80075 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCL8P80075 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL8P80075 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms