Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAE1P78406 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAE1P78406 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAE1P78406 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAE1P78406 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAE1P78406 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAE1P78406 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAE1P78406 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAE1P78406 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAE1P78406 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAE1P78406 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAE1P78406 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAE1P78406 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAE1P78406 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAE1P78406 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAE1P78406 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAE1P78406 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAE1P78406 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAE1P78406 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAE1P78406 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAE1P78406 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAE1P78406 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAE1P78406 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAE1P78406 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAE1P78406 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAE1P78406 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAE1P78406 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAE1P78406 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAE1P78406 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAE1P78406 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAE1P78406 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAE1P78406 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAE1P78406 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAE1P78406 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAE1P78406 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAE1P78406 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAE1P78406 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAE1P78406 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAE1P78406 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAE1P78406 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAE1P78406 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAE1P78406 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAE1P78406 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAE1P78406 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAE1P78406 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAE1P78406 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAE1P78406 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAE1P78406 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAE1P78406 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAE1P78406 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAE1P78406 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAE1P78406 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAE1P78406 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAE1P78406 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAE1P78406 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAE1P78406 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAE1P78406 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAE1P78406 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAE1P78406 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAE1P78406 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAE1P78406 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAE1P78406 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAE1P78406 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAE1P78406 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAE1P78406 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAE1P78406 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAE1P78406 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAE1P78406 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAE1P78406 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAE1P78406 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAE1P78406 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAE1P78406 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAE1P78406 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAE1P78406 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAE1P78406 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAE1P78406 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAE1P78406 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAE1P78406 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAE1P78406 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAE1P78406 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAE1P78406 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAE1P78406 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAE1P78406 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAE1P78406 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAE1P78406 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAE1P78406 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAE1P78406 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAE1P78406 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAE1P78406 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAE1P78406 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAE1P78406 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAE1P78406 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAE1P78406 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAE1P78406 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAE1P78406 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAE1P78406 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAE1P78406 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAE1P78406 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAE1P78406 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAE1P78406 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms