Protein–RNA interactions for Protein: P78368

CSNK1G2, Casein kinase I isoform gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2P78368 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1G2P78368 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1G2P78368 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1G2P78368 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1G2P78368 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1G2P78368 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSNK1G2P78368 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSNK1G2P78368 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSNK1G2P78368 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1G2P78368 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1G2P78368 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1G2P78368 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1G2P78368 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1G2P78368 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1G2P78368 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSNK1G2P78368 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSNK1G2P78368 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CSNK1G2P78368 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK1G2P78368 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2P78368 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2P78368 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK1G2P78368 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1G2P78368 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1G2P78368 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1G2P78368 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1G2P78368 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1G2P78368 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1G2P78368 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK1G2P78368 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK1G2P78368 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK1G2P78368 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms