Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HBA1P69905 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HBA1P69905 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HBA1P69905 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HBA1P69905 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HBA1P69905 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HBA1P69905 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HBA1P69905 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HBA1P69905 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HBA1P69905 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HBA1P69905 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HBA1P69905 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HBA1P69905 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HBA1P69905 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HBA1P69905 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HBA1P69905 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HBA1P69905 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HBA1P69905 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HBA1P69905 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HBA1P69905 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HBA1P69905 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HBA1P69905 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HBA1P69905 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HBA1P69905 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HBA1P69905 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HBA1P69905 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HBA1P69905 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HBA1P69905 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HBA1P69905 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HBA1P69905 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HBA1P69905 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HBA1P69905 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HBA1P69905 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HBA1P69905 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HBA1P69905 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HBA1P69905 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HBA1P69905 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HBA1P69905 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HBA1P69905 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HBA1P69905 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HBA1P69905 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HBA1P69905 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HBA1P69905 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HBA1P69905 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HBA1P69905 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HBA1P69905 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HBA1P69905 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HBA1P69905 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HBA1P69905 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HBA1P69905 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HBA1P69905 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HBA1P69905 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HBA1P69905 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HBA1P69905 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HBA1P69905 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HBA1P69905 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HBA1P69905 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HBA1P69905 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HBA1P69905 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HBA1P69905 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HBA1P69905 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HBA1P69905 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HBA1P69905 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HBA1P69905 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HBA1P69905 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HBA1P69905 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HBA1P69905 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HBA1P69905 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HBA1P69905 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HBA1P69905 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HBA1P69905 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HBA1P69905 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HBA1P69905 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HBA1P69905 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HBA1P69905 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HBA1P69905 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HBA1P69905 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HBA1P69905 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HBA1P69905 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HBA1P69905 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HBA1P69905 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HBA1P69905 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HBA1P69905 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HBA1P69905 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HBA1P69905 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HBA1P69905 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HBA1P69905 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HBA1P69905 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HBA1P69905 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HBA1P69905 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HBA1P69905 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HBA1P69905 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HBA1P69905 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HBA1P69905 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HBA1P69905 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HBA1P69905 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HBA1P69905 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HBA1P69905 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HBA1P69905 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HBA1P69905 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms