Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
POLR2LP62875 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2LP62875 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2LP62875 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms