Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPS29P62273 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPS29P62273 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPS29P62273 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPS29P62273 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPS29P62273 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPS29P62273 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPS29P62273 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPS29P62273 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPS29P62273 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPS29P62273 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
RPS29P62273 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPS29P62273 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPS29P62273 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPS29P62273 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPS29P62273 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPS29P62273 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPS29P62273 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPS29P62273 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPS29P62273 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPS29P62273 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPS29P62273 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPS29P62273 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPS29P62273 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPS29P62273 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RPS29P62273 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPS29P62273 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RPS29P62273 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPS29P62273 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPS29P62273 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPS29P62273 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPS29P62273 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPS29P62273 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPS29P62273 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RPS29P62273 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPS29P62273 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPS29P62273 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPS29P62273 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPS29P62273 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPS29P62273 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPS29P62273 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPS29P62273 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPS29P62273 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPS29P62273 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPS29P62273 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPS29P62273 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPS29P62273 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPS29P62273 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPS29P62273 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPS29P62273 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RPS29P62273 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPS29P62273 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPS29P62273 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPS29P62273 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPS29P62273 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPS29P62273 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPS29P62273 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPS29P62273 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RPS29P62273 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RPS29P62273 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RPS29P62273 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPS29P62273 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPS29P62273 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPS29P62273 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPS29P62273 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPS29P62273 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPS29P62273 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPS29P62273 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPS29P62273 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPS29P62273 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPS29P62273 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPS29P62273 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPS29P62273 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPS29P62273 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPS29P62273 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPS29P62273 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPS29P62273 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPS29P62273 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPS29P62273 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RPS29P62273 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPS29P62273 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPS29P62273 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPS29P62273 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPS29P62273 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPS29P62273 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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