Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFM1P61960 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFM1P61960 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFM1P61960 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFM1P61960 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFM1P61960 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFM1P61960 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFM1P61960 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFM1P61960 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFM1P61960 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFM1P61960 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFM1P61960 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFM1P61960 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFM1P61960 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFM1P61960 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UFM1P61960 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFM1P61960 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFM1P61960 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UFM1P61960 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UFM1P61960 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UFM1P61960 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFM1P61960 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UFM1P61960 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFM1P61960 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFM1P61960 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFM1P61960 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFM1P61960 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFM1P61960 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFM1P61960 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFM1P61960 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFM1P61960 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFM1P61960 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UFM1P61960 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFM1P61960 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFM1P61960 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFM1P61960 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFM1P61960 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFM1P61960 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFM1P61960 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UFM1P61960 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UFM1P61960 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UFM1P61960 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UFM1P61960 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UFM1P61960 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UFM1P61960 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UFM1P61960 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFM1P61960 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFM1P61960 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UFM1P61960 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFM1P61960 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFM1P61960 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFM1P61960 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFM1P61960 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFM1P61960 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFM1P61960 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFM1P61960 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFM1P61960 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFM1P61960 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFM1P61960 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UFM1P61960 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UFM1P61960 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFM1P61960 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFM1P61960 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFM1P61960 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFM1P61960 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFM1P61960 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFM1P61960 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFM1P61960 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFM1P61960 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFM1P61960 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFM1P61960 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFM1P61960 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UFM1P61960 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFM1P61960 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFM1P61960 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFM1P61960 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UFM1P61960 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFM1P61960 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFM1P61960 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFM1P61960 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFM1P61960 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFM1P61960 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFM1P61960 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFM1P61960 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFM1P61960 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UFM1P61960 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFM1P61960 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFM1P61960 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFM1P61960 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFM1P61960 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFM1P61960 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFM1P61960 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UFM1P61960 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UFM1P61960 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UFM1P61960 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UFM1P61960 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UFM1P61960 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UFM1P61960 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UFM1P61960 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UFM1P61960 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms