Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH13P55290 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH13P55290 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH13P55290 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH13P55290 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH13P55290 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH13P55290 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH13P55290 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH13P55290 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH13P55290 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH13P55290 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH13P55290 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH13P55290 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH13P55290 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH13P55290 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH13P55290 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH13P55290 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH13P55290 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH13P55290 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH13P55290 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH13P55290 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH13P55290 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH13P55290 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH13P55290 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH13P55290 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH13P55290 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH13P55290 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH13P55290 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH13P55290 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH13P55290 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH13P55290 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH13P55290 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH13P55290 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH13P55290 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH13P55290 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH13P55290 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH13P55290 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH13P55290 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH13P55290 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH13P55290 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH13P55290 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH13P55290 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH13P55290 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH13P55290 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH13P55290 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH13P55290 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH13P55290 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH13P55290 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH13P55290 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH13P55290 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH13P55290 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH13P55290 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH13P55290 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH13P55290 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH13P55290 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH13P55290 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH13P55290 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH13P55290 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH13P55290 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH13P55290 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH13P55290 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH13P55290 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH13P55290 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH13P55290 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH13P55290 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH13P55290 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH13P55290 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH13P55290 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH13P55290 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH13P55290 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH13P55290 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH13P55290 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH13P55290 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH13P55290 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH13P55290 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH13P55290 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH13P55290 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH13P55290 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH13P55290 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH13P55290 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH13P55290 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH13P55290 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH13P55290 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH13P55290 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH13P55290 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH13P55290 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH13P55290 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH13P55290 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH13P55290 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH13P55290 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH13P55290 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH13P55290 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH13P55290 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH13P55290 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH13P55290 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH13P55290 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH13P55290 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH13P55290 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH13P55290 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH13P55290 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms