Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPHB4P54760 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPHB4P54760 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPHB4P54760 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPHB4P54760 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms