Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA2D1P54289 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D1P54289 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA2D1P54289 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms