Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATXN3P54252 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN3P54252 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN3P54252 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms