Protein–RNA interactions for Protein: P54070

KTR6, Mannosyltransferase KTR6, yeast

Predictions only

Length 446 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR6	P54070	LPD1	YFL018C	1500 nt		7.57	□□□□□ -1.2
KTR6	P54070	MAS2	YHR024C	1449 nt		7.56	□□□□□ -1.2
KTR6	P54070	PDC5	YLR134W	1692 nt		7.56	□□□□□ -1.2
KTR6	P54070	BDS1	YOL164W	1941 nt		7.56	□□□□□ -1.2
KTR6	P54070	SKP1	YDR328C	585 nt		7.55	□□□□□ -1.2
KTR6	P54070	OPI1	YHL020C	1215 nt		7.55	□□□□□ -1.2
KTR6	P54070	PRY2	YKR013W	990 nt		7.55	□□□□□ -1.2
KTR6	P54070	RCF2	YNR018W	675 nt		7.55	□□□□□ -1.2
KTR6	P54070	UME1	YPL139C	1383 nt		7.55	□□□□□ -1.2
KTR6	P54070	CKI1	YLR133W	1749 nt		7.55	□□□□□ -1.2
KTR6	P54070	STF1	YDL130W-A	261 nt		7.54	□□□□□ -1.2
KTR6	P54070	MDH2	YOL126C	1134 nt		7.54	□□□□□ -1.2
KTR6	P54070	GUT1	YHL032C	2130 nt		7.54	□□□□□ -1.2
KTR6	P54070	SLM3	YDL033C	1254 nt		7.53	□□□□□ -1.2
KTR6	P54070	CAR2	YLR438W	1275 nt		7.53	□□□□□ -1.2
KTR6	P54070	ECM27	YJR106W	2178 nt		7.52	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	PMT7	YDR307W	1989 nt		7.52	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	LEO1	YOR123C	1395 nt		7.52	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	PIL1	YGR086C	1020 nt		7.52	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	YBL111C	YBL111C	2004 nt		7.51	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	YAL019W-A	YAL019W-A	570 nt		7.51	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	RSC9	YML127W	1746 nt		7.5	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	SNA3	YJL151C	402 nt		7.5	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	PTH2	YBL057C	627 nt		7.5	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	YPQ1	YOL092W	927 nt		7.5	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	RUP1	YOR138C	2016 nt		7.49	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	YPL067C	YPL067C	597 nt		7.49	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	SGF73	YGL066W	1974 nt		7.48	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	CYS3	YAL012W	1185 nt		7.48	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	FIT1	YDR534C	1587 nt		7.47	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	LAT1	YNL071W	1449 nt		7.47	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	SNF7	YLR025W	723 nt		7.47	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	MBF1	YOR298C-A	456 nt		7.47	□□□□□ -1.21
KTR6	P54070	YEL034C-A	YEL034C-A	603 nt		7.46	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	COS10	YNR075W	1125 nt		7.46	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	PFS2	YNL317W	1398 nt		7.46	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	CCW12	YLR110C	402 nt		7.45	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	YML122C	YML122C	381 nt		7.45	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	YJL213W	YJL213W	996 nt		7.44	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	YOX1	YML027W	1158 nt		7.44	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	YAH1	YPL252C	519 nt		7.44	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	HSV2	YGR223C	1347 nt		7.44	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	CST26	YBR042C	1194 nt		7.43	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	YBL113C	YBL113C	2379 nt		7.43	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	HNM1	YGL077C	1692 nt		7.42	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	TRR2	YHR106W	1029 nt		7.42	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	YHR131C	YHR131C	2553 nt		7.41	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	PAM17	YKR065C	594 nt		7.41	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	TPI1	YDR050C	747 nt		7.4	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	PRS4	YBL068W	981 nt		7.4	□□□□□ -1.22
KTR6	P54070	RTC2	YBR147W	891 nt		7.39	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	Q0010	Q0010	387 nt		7.39	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	TCB1	YOR086C	3561 nt		7.39	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	AFG3	YER017C	2286 nt		7.39	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	YRF1-1	YDR545W	5391 nt		7.38	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	YRF1-5	YLR467W	5391 nt		7.38	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	YRF1-8	YOR396W	5391 nt		7.38	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	PDA1	YER178W	1263 nt		7.38	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	MET30	YIL046W	1923 nt		7.38	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	CIT2	YCR005C	1383 nt		7.37	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	ERG24	YNL280C	1317 nt		7.37	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	DCR2	YLR361C	1737 nt		7.36	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	URA1	YKL216W	945 nt		7.36	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	NFS1	YCL017C	1494 nt		7.36	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	DML1	YMR211W	1428 nt		7.35	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	YPQ2	YDR352W	954 nt		7.35	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	AIM46	YHR199C	933 nt		7.35	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	snR30	snR30	606 nt		7.35	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	NAF1	YNL124W	1479 nt		7.35	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	YDR327W	YDR327W	327 nt		7.34	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	RTC4	YNL254C	1206 nt		7.34	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	ZIM17	YNL310C	525 nt		7.34	□□□□□ -1.23
KTR6	P54070	YGL260W	YGL260W	231 nt		7.33	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	YNL190W	YNL190W	615 nt		7.33	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	YER152C	YER152C	1332 nt		7.32	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	RDR1	YOR380W	1641 nt		7.32	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	PET117	YER058W	324 nt		7.32	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	MCP1	YOR228C	909 nt		7.32	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	GNA1	YFL017C	480 nt		7.31	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	YPR130C	YPR130C	408 nt		7.31	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	TOP3	YLR234W	1971 nt		7.31	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	TUB1	YML085C	1344 nt		7.3	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	YKL147C	YKL147C	618 nt		7.3	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	YLR030W	YLR030W	792 nt		7.3	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	HXT9	YJL219W	1704 nt		7.3	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	SUF3	tG(CCC)D	72 nt		7.29	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	YJL144W	YJL144W	315 nt		7.29	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	YMR074C	YMR074C	438 nt		7.29	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	YPL264C	YPL264C	1062 nt		7.29	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	DPM1	YPR183W	804 nt		7.29	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	DMC1	YER179W	1005 nt		7.28	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	YOR041C	YOR041C	432 nt		7.28	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	CCR4	YAL021C	2514 nt		7.28	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	MPE1	YKL059C	1326 nt		7.27	□□□□□ -1.24
KTR6	P54070	YLR162W	YLR162W	357 nt		7.27	□□□□□ -1.25
KTR6	P54070	GET4	YOR164C	939 nt		7.27	□□□□□ -1.25
KTR6	P54070	LIP5	YOR196C	1245 nt		7.27	□□□□□ -1.25
KTR6	P54070	LGE1	YPL055C	999 nt		7.27	□□□□□ -1.25
KTR6	P54070	YCL049C	YCL049C	939 nt		7.27	□□□□□ -1.25
KTR6	P54070	CDC7	YDL017W	1524 nt		7.27	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.6 ms