Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A1P53007 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A1P53007 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC25A1P53007 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms