Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCNN1GP51170 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCNN1GP51170 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCNN1GP51170 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCNN1GP51170 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCNN1GP51170 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCNN1GP51170 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCNN1GP51170 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCNN1GP51170 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCNN1GP51170 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCNN1GP51170 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCNN1GP51170 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCNN1GP51170 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCNN1GP51170 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCNN1GP51170 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCNN1GP51170 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCNN1GP51170 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms