Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCT8P50990 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCT8P50990 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCT8P50990 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCT8P50990 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT8P50990 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCT8P50990 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT8P50990 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT8P50990 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT8P50990 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT8P50990 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT8P50990 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT8P50990 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCT8P50990 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCT8P50990 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT8P50990 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT8P50990 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT8P50990 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT8P50990 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT8P50990 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT8P50990 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT8P50990 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT8P50990 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT8P50990 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT8P50990 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT8P50990 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT8P50990 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT8P50990 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT8P50990 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCT8P50990 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCT8P50990 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCT8P50990 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCT8P50990 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT8P50990 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT8P50990 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT8P50990 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT8P50990 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT8P50990 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT8P50990 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT8P50990 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT8P50990 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT8P50990 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT8P50990 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT8P50990 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT8P50990 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT8P50990 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT8P50990 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT8P50990 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT8P50990 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT8P50990 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT8P50990 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT8P50990 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCT8P50990 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT8P50990 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT8P50990 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT8P50990 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT8P50990 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT8P50990 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT8P50990 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT8P50990 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT8P50990 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8P50990 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8P50990 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8P50990 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8P50990 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8P50990 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8P50990 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8P50990 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8P50990 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8P50990 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT8P50990 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT8P50990 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT8P50990 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT8P50990 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT8P50990 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT8P50990 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT8P50990 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT8P50990 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT8P50990 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT8P50990 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT8P50990 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT8P50990 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT8P50990 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT8P50990 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCT8P50990 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCT8P50990 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCT8P50990 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCT8P50990 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCT8P50990 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCT8P50990 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCT8P50990 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCT8P50990 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCT8P50990 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCT8P50990 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCT8P50990 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCT8P50990 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCT8P50990 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT8P50990 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT8P50990 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT8P50990 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms