Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PSEN1P49768 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSEN1P49768 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms