Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB2P49721 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms