Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT3P49368 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT3P49368 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT3P49368 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCT3P49368 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCT3P49368 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCT3P49368 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCT3P49368 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT3P49368 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT3P49368 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT3P49368 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT3P49368 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT3P49368 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT3P49368 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT3P49368 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT3P49368 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT3P49368 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT3P49368 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT3P49368 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT3P49368 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT3P49368 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT3P49368 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT3P49368 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT3P49368 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT3P49368 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT3P49368 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT3P49368 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT3P49368 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT3P49368 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT3P49368 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT3P49368 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT3P49368 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT3P49368 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT3P49368 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT3P49368 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT3P49368 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT3P49368 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT3P49368 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT3P49368 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT3P49368 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT3P49368 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT3P49368 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT3P49368 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT3P49368 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT3P49368 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT3P49368 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT3P49368 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT3P49368 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT3P49368 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT3P49368 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT3P49368 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT3P49368 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT3P49368 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT3P49368 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT3P49368 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT3P49368 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT3P49368 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT3P49368 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT3P49368 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT3P49368 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT3P49368 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT3P49368 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCT3P49368 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT3P49368 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT3P49368 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT3P49368 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT3P49368 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT3P49368 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT3P49368 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT3P49368 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT3P49368 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT3P49368 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT3P49368 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT3P49368 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT3P49368 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT3P49368 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT3P49368 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT3P49368 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT3P49368 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT3P49368 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT3P49368 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT3P49368 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT3P49368 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT3P49368 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT3P49368 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT3P49368 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT3P49368 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT3P49368 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT3P49368 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT3P49368 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT3P49368 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT3P49368 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT3P49368 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT3P49368 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT3P49368 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT3P49368 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT3P49368 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT3P49368 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT3P49368 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT3P49368 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms