Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK8P49336 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK8P49336 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK8P49336 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK8P49336 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK8P49336 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK8P49336 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK8P49336 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK8P49336 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK8P49336 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK8P49336 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK8P49336 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK8P49336 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK8P49336 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK8P49336 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK8P49336 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK8P49336 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK8P49336 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK8P49336 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK8P49336 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK8P49336 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK8P49336 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK8P49336 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK8P49336 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK8P49336 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK8P49336 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK8P49336 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK8P49336 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK8P49336 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK8P49336 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK8P49336 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK8P49336 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK8P49336 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK8P49336 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK8P49336 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK8P49336 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK8P49336 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK8P49336 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK8P49336 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK8P49336 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK8P49336 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK8P49336 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK8P49336 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK8P49336 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CDK8P49336 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK8P49336 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK8P49336 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK8P49336 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK8P49336 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK8P49336 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK8P49336 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK8P49336 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK8P49336 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK8P49336 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK8P49336 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK8P49336 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK8P49336 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK8P49336 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK8P49336 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK8P49336 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK8P49336 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK8P49336 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK8P49336 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK8P49336 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK8P49336 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK8P49336 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK8P49336 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK8P49336 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK8P49336 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK8P49336 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK8P49336 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK8P49336 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK8P49336 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK8P49336 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK8P49336 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK8P49336 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK8P49336 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK8P49336 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK8P49336 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK8P49336 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK8P49336 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK8P49336 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK8P49336 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK8P49336 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK8P49336 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK8P49336 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK8P49336 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK8P49336 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK8P49336 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK8P49336 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK8P49336 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK8P49336 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK8P49336 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK8P49336 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK8P49336 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK8P49336 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK8P49336 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK8P49336 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK8P49336 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK8P49336 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms