Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TDO2P48775 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TDO2P48775 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TDO2P48775 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TDO2P48775 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TDO2P48775 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TDO2P48775 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TDO2P48775 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TDO2P48775 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TDO2P48775 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TDO2P48775 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TDO2P48775 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TDO2P48775 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TDO2P48775 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TDO2P48775 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TDO2P48775 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TDO2P48775 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TDO2P48775 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TDO2P48775 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TDO2P48775 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TDO2P48775 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TDO2P48775 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TDO2P48775 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TDO2P48775 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TDO2P48775 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TDO2P48775 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TDO2P48775 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TDO2P48775 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TDO2P48775 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TDO2P48775 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TDO2P48775 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TDO2P48775 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TDO2P48775 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TDO2P48775 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TDO2P48775 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TDO2P48775 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TDO2P48775 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TDO2P48775 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TDO2P48775 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TDO2P48775 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TDO2P48775 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TDO2P48775 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TDO2P48775 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TDO2P48775 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TDO2P48775 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TDO2P48775 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TDO2P48775 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TDO2P48775 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TDO2P48775 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TDO2P48775 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TDO2P48775 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TDO2P48775 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TDO2P48775 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TDO2P48775 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TDO2P48775 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TDO2P48775 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TDO2P48775 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TDO2P48775 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TDO2P48775 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TDO2P48775 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TDO2P48775 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TDO2P48775 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TDO2P48775 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TDO2P48775 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TDO2P48775 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TDO2P48775 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TDO2P48775 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TDO2P48775 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TDO2P48775 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TDO2P48775 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TDO2P48775 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TDO2P48775 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TDO2P48775 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TDO2P48775 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TDO2P48775 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TDO2P48775 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TDO2P48775 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TDO2P48775 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TDO2P48775 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TDO2P48775 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TDO2P48775 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TDO2P48775 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TDO2P48775 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TDO2P48775 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TDO2P48775 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TDO2P48775 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TDO2P48775 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TDO2P48775 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TDO2P48775 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TDO2P48775 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TDO2P48775 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TDO2P48775 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TDO2P48775 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TDO2P48775 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TDO2P48775 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TDO2P48775 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TDO2P48775 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TDO2P48775 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TDO2P48775 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TDO2P48775 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms