Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LSSP48449 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSSP48449 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSSP48449 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSSP48449 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSSP48449 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSSP48449 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LSSP48449 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSSP48449 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSSP48449 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSSP48449 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSSP48449 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LSSP48449 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSSP48449 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSSP48449 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSSP48449 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LSSP48449 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSSP48449 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSSP48449 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSSP48449 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSSP48449 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSSP48449 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LSSP48449 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LSSP48449 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LSSP48449 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSSP48449 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSSP48449 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSSP48449 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSSP48449 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSSP48449 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSSP48449 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSSP48449 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSSP48449 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSSP48449 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSSP48449 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSSP48449 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSSP48449 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSSP48449 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSSP48449 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSSP48449 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSSP48449 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSSP48449 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSSP48449 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSSP48449 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSSP48449 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSSP48449 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSSP48449 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSSP48449 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSSP48449 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSSP48449 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSSP48449 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSSP48449 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSSP48449 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSSP48449 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSSP48449 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LSSP48449 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSSP48449 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSSP48449 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSSP48449 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSSP48449 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSSP48449 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSSP48449 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSSP48449 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSSP48449 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LSSP48449 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSSP48449 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSSP48449 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSSP48449 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSSP48449 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSSP48449 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSSP48449 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LSSP48449 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSSP48449 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSSP48449 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSSP48449 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSSP48449 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LSSP48449 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSSP48449 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSSP48449 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSSP48449 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSSP48449 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSSP48449 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSSP48449 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSSP48449 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LSSP48449 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSSP48449 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSSP48449 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSSP48449 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSSP48449 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSSP48449 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSSP48449 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSSP48449 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LSSP48449 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSSP48449 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSSP48449 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSSP48449 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSSP48449 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LSSP48449 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LSSP48449 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSSP48449 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms