Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC6A11P48066 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC6A11P48066 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC6A11P48066 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC6A11P48066 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms