Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRCC3P46736 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCC3P46736 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRCC3P46736 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRCC3P46736 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms