Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TNNT2P45379 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TNNT2P45379 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNNT2P45379 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNNT2P45379 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNNT2P45379 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNNT2P45379 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNNT2P45379 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNNT2P45379 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNNT2P45379 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNNT2P45379 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNNT2P45379 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNNT2P45379 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNNT2P45379 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNNT2P45379 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNNT2P45379 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNNT2P45379 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNNT2P45379 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNNT2P45379 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNNT2P45379 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNNT2P45379 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNNT2P45379 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNNT2P45379 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNNT2P45379 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNNT2P45379 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNNT2P45379 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms