Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR4A2P43354 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR4A2P43354 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms