Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF5P43026 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF5P43026 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF5P43026 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF5P43026 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF5P43026 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF5P43026 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF5P43026 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF5P43026 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF5P43026 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF5P43026 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF5P43026 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF5P43026 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF5P43026 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF5P43026 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF5P43026 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF5P43026 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF5P43026 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDF5P43026 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF5P43026 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF5P43026 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF5P43026 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF5P43026 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF5P43026 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF5P43026 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF5P43026 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF5P43026 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF5P43026 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF5P43026 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF5P43026 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF5P43026 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF5P43026 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF5P43026 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF5P43026 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF5P43026 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF5P43026 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF5P43026 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF5P43026 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF5P43026 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF5P43026 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF5P43026 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF5P43026 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF5P43026 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF5P43026 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF5P43026 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF5P43026 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF5P43026 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF5P43026 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF5P43026 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF5P43026 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF5P43026 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF5P43026 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF5P43026 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF5P43026 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF5P43026 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF5P43026 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF5P43026 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF5P43026 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF5P43026 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF5P43026 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF5P43026 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF5P43026 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF5P43026 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF5P43026 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF5P43026 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF5P43026 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF5P43026 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF5P43026 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF5P43026 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF5P43026 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF5P43026 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF5P43026 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF5P43026 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF5P43026 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF5P43026 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF5P43026 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF5P43026 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF5P43026 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF5P43026 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF5P43026 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF5P43026 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF5P43026 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GDF5P43026 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GDF5P43026 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF5P43026 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms