Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FEN1P39748 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FEN1P39748 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FEN1P39748 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FEN1P39748 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FEN1P39748 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FEN1P39748 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FEN1P39748 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FEN1P39748 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FEN1P39748 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FEN1P39748 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FEN1P39748 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FEN1P39748 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FEN1P39748 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FEN1P39748 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FEN1P39748 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FEN1P39748 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FEN1P39748 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FEN1P39748 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FEN1P39748 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FEN1P39748 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FEN1P39748 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FEN1P39748 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FEN1P39748 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FEN1P39748 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FEN1P39748 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FEN1P39748 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FEN1P39748 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FEN1P39748 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FEN1P39748 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FEN1P39748 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FEN1P39748 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FEN1P39748 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FEN1P39748 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FEN1P39748 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FEN1P39748 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FEN1P39748 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FEN1P39748 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FEN1P39748 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FEN1P39748 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FEN1P39748 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FEN1P39748 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FEN1P39748 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FEN1P39748 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FEN1P39748 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FEN1P39748 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FEN1P39748 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FEN1P39748 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FEN1P39748 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FEN1P39748 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FEN1P39748 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FEN1P39748 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FEN1P39748 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FEN1P39748 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FEN1P39748 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FEN1P39748 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FEN1P39748 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FEN1P39748 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FEN1P39748 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FEN1P39748 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FEN1P39748 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FEN1P39748 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FEN1P39748 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FEN1P39748 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FEN1P39748 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FEN1P39748 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FEN1P39748 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FEN1P39748 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FEN1P39748 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FEN1P39748 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FEN1P39748 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FEN1P39748 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FEN1P39748 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FEN1P39748 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FEN1P39748 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FEN1P39748 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FEN1P39748 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FEN1P39748 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FEN1P39748 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FEN1P39748 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FEN1P39748 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FEN1P39748 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FEN1P39748 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FEN1P39748 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FEN1P39748 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FEN1P39748 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FEN1P39748 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FEN1P39748 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FEN1P39748 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FEN1P39748 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FEN1P39748 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FEN1P39748 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FEN1P39748 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FEN1P39748 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FEN1P39748 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FEN1P39748 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FEN1P39748 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FEN1P39748 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FEN1P39748 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FEN1P39748 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms