Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL3P39023 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL3P39023 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL3P39023 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL3P39023 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL3P39023 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL3P39023 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL3P39023 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL3P39023 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL3P39023 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL3P39023 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL3P39023 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL3P39023 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL3P39023 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL3P39023 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL3P39023 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL3P39023 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL3P39023 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL3P39023 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL3P39023 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL3P39023 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL3P39023 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL3P39023 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL3P39023 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL3P39023 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL3P39023 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL3P39023 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL3P39023 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL3P39023 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL3P39023 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL3P39023 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL3P39023 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL3P39023 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL3P39023 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL3P39023 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL3P39023 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL3P39023 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL3P39023 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL3P39023 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL3P39023 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL3P39023 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL3P39023 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL3P39023 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL3P39023 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL3P39023 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL3P39023 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL3P39023 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL3P39023 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL3P39023 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL3P39023 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL3P39023 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL3P39023 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL3P39023 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL3P39023 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL3P39023 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL3P39023 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL3P39023 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL3P39023 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL3P39023 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL3P39023 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL3P39023 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL3P39023 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL3P39023 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL3P39023 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL3P39023 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL3P39023 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL3P39023 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL3P39023 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL3P39023 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL3P39023 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL3P39023 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL3P39023 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL3P39023 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL3P39023 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL3P39023 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL3P39023 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL3P39023 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL3P39023 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL3P39023 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL3P39023 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL3P39023 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL3P39023 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL3P39023 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL3P39023 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL3P39023 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL3P39023 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL3P39023 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL3P39023 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL3P39023 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL3P39023 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL3P39023 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL3P39023 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL3P39023 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL3P39023 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL3P39023 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL3P39023 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL3P39023 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL3P39023 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL3P39023 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL3P39023 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms