Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPARGP37231 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPARGP37231 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPARGP37231 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPARGP37231 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPARGP37231 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPARGP37231 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARGP37231 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARGP37231 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARGP37231 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARGP37231 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARGP37231 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARGP37231 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARGP37231 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPARGP37231 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPARGP37231 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPARGP37231 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPARGP37231 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPARGP37231 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPARGP37231 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPARGP37231 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARGP37231 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARGP37231 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARGP37231 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARGP37231 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARGP37231 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARGP37231 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARGP37231 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARGP37231 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARGP37231 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARGP37231 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARGP37231 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARGP37231 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARGP37231 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARGP37231 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPARGP37231 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPARGP37231 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPARGP37231 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPARGP37231 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPARGP37231 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPARGP37231 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPARGP37231 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPARGP37231 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPARGP37231 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPARGP37231 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGP37231 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGP37231 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGP37231 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGP37231 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGP37231 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGP37231 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGP37231 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGP37231 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGP37231 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGP37231 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGP37231 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGP37231 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGP37231 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPARGP37231 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPARGP37231 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPARGP37231 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPARGP37231 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPARGP37231 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPARGP37231 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPARGP37231 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPARGP37231 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPARGP37231 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPARGP37231 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPARGP37231 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPARGP37231 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPARGP37231 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPARGP37231 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPARGP37231 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPARGP37231 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPARGP37231 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPARGP37231 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPARGP37231 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPARGP37231 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPARGP37231 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPARGP37231 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPARGP37231 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGP37231 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGP37231 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPARGP37231 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPARGP37231 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPARGP37231 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPARGP37231 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPARGP37231 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPARGP37231 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PPARGP37231 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPARGP37231 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPARGP37231 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPARGP37231 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPARGP37231 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PPARGP37231 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPARGP37231 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPARGP37231 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPARGP37231 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPARGP37231 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPARGP37231 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms