Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGFBR1P36897 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR1P36897 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR1P36897 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms