Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHI3L1P36222 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHI3L1P36222 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms