Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COPB2P35606 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COPB2P35606 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COPB2P35606 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COPB2P35606 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COPB2P35606 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COPB2P35606 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COPB2P35606 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
COPB2P35606 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COPB2P35606 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COPB2P35606 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COPB2P35606 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
COPB2P35606 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COPB2P35606 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
COPB2P35606 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COPB2P35606 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COPB2P35606 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COPB2P35606 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
COPB2P35606 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COPB2P35606 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COPB2P35606 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COPB2P35606 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COPB2P35606 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COPB2P35606 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COPB2P35606 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COPB2P35606 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
COPB2P35606 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COPB2P35606 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COPB2P35606 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COPB2P35606 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COPB2P35606 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COPB2P35606 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COPB2P35606 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COPB2P35606 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COPB2P35606 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COPB2P35606 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COPB2P35606 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COPB2P35606 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COPB2P35606 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
COPB2P35606 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COPB2P35606 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COPB2P35606 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COPB2P35606 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COPB2P35606 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COPB2P35606 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COPB2P35606 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COPB2P35606 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COPB2P35606 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
COPB2P35606 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COPB2P35606 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COPB2P35606 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
COPB2P35606 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COPB2P35606 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COPB2P35606 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
COPB2P35606 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COPB2P35606 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COPB2P35606 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COPB2P35606 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
COPB2P35606 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COPB2P35606 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
COPB2P35606 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COPB2P35606 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COPB2P35606 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COPB2P35606 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COPB2P35606 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COPB2P35606 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COPB2P35606 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COPB2P35606 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COPB2P35606 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COPB2P35606 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COPB2P35606 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COPB2P35606 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COPB2P35606 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COPB2P35606 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COPB2P35606 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COPB2P35606 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COPB2P35606 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
COPB2P35606 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
COPB2P35606 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COPB2P35606 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COPB2P35606 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
COPB2P35606 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COPB2P35606 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COPB2P35606 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COPB2P35606 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COPB2P35606 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COPB2P35606 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COPB2P35606 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COPB2P35606 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COPB2P35606 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COPB2P35606 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COPB2P35606 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COPB2P35606 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COPB2P35606 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
COPB2P35606 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COPB2P35606 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COPB2P35606 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COPB2P35606 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COPB2P35606 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COPB2P35606 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms