Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SFNP31947 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SFNP31947 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SFNP31947 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SFNP31947 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SFNP31947 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SFNP31947 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SFNP31947 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SFNP31947 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SFNP31947 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SFNP31947 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SFNP31947 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SFNP31947 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SFNP31947 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SFNP31947 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SFNP31947 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SFNP31947 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SFNP31947 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SFNP31947 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SFNP31947 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SFNP31947 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SFNP31947 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SFNP31947 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SFNP31947 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SFNP31947 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SFNP31947 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SFNP31947 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SFNP31947 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SFNP31947 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SFNP31947 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SFNP31947 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SFNP31947 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SFNP31947 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SFNP31947 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SFNP31947 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SFNP31947 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SFNP31947 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SFNP31947 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SFNP31947 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SFNP31947 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SFNP31947 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SFNP31947 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SFNP31947 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SFNP31947 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SFNP31947 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SFNP31947 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SFNP31947 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SFNP31947 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SFNP31947 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SFNP31947 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SFNP31947 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SFNP31947 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SFNP31947 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SFNP31947 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SFNP31947 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SFNP31947 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SFNP31947 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SFNP31947 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SFNP31947 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SFNP31947 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SFNP31947 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SFNP31947 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SFNP31947 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SFNP31947 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SFNP31947 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SFNP31947 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFNP31947 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFNP31947 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFNP31947 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFNP31947 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SFNP31947 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SFNP31947 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SFNP31947 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SFNP31947 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SFNP31947 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SFNP31947 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SFNP31947 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SFNP31947 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SFNP31947 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SFNP31947 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SFNP31947 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SFNP31947 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SFNP31947 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SFNP31947 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SFNP31947 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SFNP31947 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SFNP31947 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SFNP31947 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SFNP31947 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFNP31947 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFNP31947 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFNP31947 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFNP31947 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFNP31947 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFNP31947 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SFNP31947 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SFNP31947 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SFNP31947 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SFNP31947 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SFNP31947 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms