Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTR1BP28222 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTR1BP28222 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTR1BP28222 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTR1BP28222 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR1BP28222 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR1BP28222 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR1BP28222 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR1BP28222 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR1BP28222 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR1BP28222 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR1BP28222 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR1BP28222 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTR1BP28222 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTR1BP28222 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTR1BP28222 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTR1BP28222 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTR1BP28222 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms