Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTFRP26992 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFRP26992 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTFRP26992 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTFRP26992 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTFRP26992 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTFRP26992 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTFRP26992 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTFRP26992 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTFRP26992 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTFRP26992 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTFRP26992 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTFRP26992 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTFRP26992 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTFRP26992 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTFRP26992 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTFRP26992 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms