Protein–RNA interactions for Protein: P25579

LRE1, Laminarase-resistance protein LRE1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LRE1P25579 YPL041CYPL041C 624 nt7.62□□□□□ -1.19
LRE1P25579 SNF7YLR025W 723 nt7.61□□□□□ -1.19
LRE1P25579 VPS65YLR322W 315 nt7.61□□□□□ -1.19
LRE1P25579 CAR2YLR438W 1275 nt7.61□□□□□ -1.19
LRE1P25579 PDC5YLR134W 1692 nt7.6□□□□□ -1.19
LRE1P25579 RFC1YOR217W 2586 nt7.6□□□□□ -1.19
LRE1P25579 MBF1YOR298C-A 456 nt7.6□□□□□ -1.19
LRE1P25579 ADE16YLR028C 1776 nt7.6□□□□□ -1.19
LRE1P25579 YJL213WYJL213W 996 nt7.59□□□□□ -1.19
LRE1P25579 URA1YKL216W 945 nt7.59□□□□□ -1.19
LRE1P25579 YML122CYML122C 381 nt7.59□□□□□ -1.19
LRE1P25579 RCF2YNR018W 675 nt7.59□□□□□ -1.19
LRE1P25579 CST26YBR042C 1194 nt7.58□□□□□ -1.2
LRE1P25579 CYS3YAL012W 1185 nt7.57□□□□□ -1.2
LRE1P25579 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.56□□□□□ -1.2
LRE1P25579 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.56□□□□□ -1.2
LRE1P25579 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.56□□□□□ -1.2
LRE1P25579 RUP1YOR138C 2016 nt7.56□□□□□ -1.2
LRE1P25579 PRS4YBL068W 981 nt7.56□□□□□ -1.2
LRE1P25579 DUS3YLR401C 2007 nt7.56□□□□□ -1.2
LRE1P25579 RSC9YML127W 1746 nt7.55□□□□□ -1.2
LRE1P25579 ILV2YMR108W 2064 nt7.55□□□□□ -1.2
LRE1P25579 PAM17YKR065C 594 nt7.55□□□□□ -1.2
LRE1P25579 CCW12YLR110C 402 nt7.55□□□□□ -1.2
LRE1P25579 TRR2YHR106W 1029 nt7.54□□□□□ -1.2
LRE1P25579 MDH2YOL126C 1134 nt7.54□□□□□ -1.2
LRE1P25579 LEO1YOR123C 1395 nt7.54□□□□□ -1.2
LRE1P25579 PMT7YDR307W 1989 nt7.53□□□□□ -1.2
LRE1P25579 GNP1YDR508C 1992 nt7.53□□□□□ -1.2
LRE1P25579 YPQ2YDR352W 954 nt7.53□□□□□ -1.2
LRE1P25579 CIT2YCR005C 1383 nt7.52□□□□□ -1.21
LRE1P25579 YJL144WYJL144W 315 nt7.52□□□□□ -1.21
LRE1P25579 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.51□□□□□ -1.21
LRE1P25579 SNA3YJL151C 402 nt7.51□□□□□ -1.21
LRE1P25579 MCP1YOR228C 909 nt7.51□□□□□ -1.21
LRE1P25579 DCR2YLR361C 1737 nt7.51□□□□□ -1.21
LRE1P25579 SGF73YGL066W 1974 nt7.51□□□□□ -1.21
LRE1P25579 DML1YMR211W 1428 nt7.51□□□□□ -1.21
LRE1P25579 NAF1YNL124W 1479 nt7.5□□□□□ -1.21
LRE1P25579 YAH1YPL252C 519 nt7.5□□□□□ -1.21
LRE1P25579 FIT1YDR534C 1587 nt7.5□□□□□ -1.21
LRE1P25579 YER152CYER152C 1332 nt7.5□□□□□ -1.21
LRE1P25579 NFS1YCL017C 1494 nt7.49□□□□□ -1.21
LRE1P25579 COG1YGL223C 1254 nt7.49□□□□□ -1.21
LRE1P25579 AIM46YHR199C 933 nt7.49□□□□□ -1.21
LRE1P25579 RTC4YNL254C 1206 nt7.49□□□□□ -1.21
LRE1P25579 ZIM17YNL310C 525 nt7.49□□□□□ -1.21
LRE1P25579 RTC2YBR147W 891 nt7.49□□□□□ -1.21
LRE1P25579 DTR1YBR180W 1719 nt7.49□□□□□ -1.21
LRE1P25579 AAD14YNL331C 1131 nt7.48□□□□□ -1.21
LRE1P25579 ERG24YNL280C 1317 nt7.48□□□□□ -1.21
LRE1P25579 AFG3YER017C 2286 nt7.47□□□□□ -1.21
LRE1P25579 snR30snR30 606 nt7.47□□□□□ -1.21
LRE1P25579 TCB1YOR086C 3561 nt7.47□□□□□ -1.21
LRE1P25579 PDA1YER178W 1263 nt7.46□□□□□ -1.22
LRE1P25579 PFS2YNL317W 1398 nt7.46□□□□□ -1.22
LRE1P25579 HNM1YGL077C 1692 nt7.45□□□□□ -1.22
LRE1P25579 YBL113CYBL113C 2379 nt7.45□□□□□ -1.22
LRE1P25579 TPI1YDR050C 747 nt7.45□□□□□ -1.22
LRE1P25579 TUB1YML085C 1344 nt7.45□□□□□ -1.22
LRE1P25579 SML1YML058W 315 nt7.44□□□□□ -1.22
LRE1P25579 PUS4YNL292W 1212 nt7.44□□□□□ -1.22
LRE1P25579 LGE1YPL055C 999 nt7.44□□□□□ -1.22
LRE1P25579 TOK1YJL093C 2076 nt7.43□□□□□ -1.22
LRE1P25579 PET117YER058W 324 nt7.43□□□□□ -1.22
LRE1P25579 YDR327WYDR327W 327 nt7.42□□□□□ -1.22
LRE1P25579 MDL2YPL270W 2322 nt7.41□□□□□ -1.22
LRE1P25579 GAL2YLR081W 1725 nt7.41□□□□□ -1.22
LRE1P25579 YGL260WYGL260W 231 nt7.41□□□□□ -1.22
LRE1P25579 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.4□□□□□ -1.22
LRE1P25579 YLR162WYLR162W 357 nt7.4□□□□□ -1.22
LRE1P25579 GET4YOR164C 939 nt7.4□□□□□ -1.22
LRE1P25579 SPE3YPR069C 882 nt7.4□□□□□ -1.22
LRE1P25579 YPR130CYPR130C 408 nt7.4□□□□□ -1.22
LRE1P25579 DPM1YPR183W 804 nt7.4□□□□□ -1.22
LRE1P25579 YCL049CYCL049C 939 nt7.4□□□□□ -1.22
LRE1P25579 HSV2YGR223C 1347 nt7.4□□□□□ -1.22
LRE1P25579 MPE1YKL059C 1326 nt7.4□□□□□ -1.22
LRE1P25579 ERG10YPL028W 1197 nt7.39□□□□□ -1.23
LRE1P25579 TOP3YLR234W 1971 nt7.39□□□□□ -1.23
LRE1P25579 MLS1YNL117W 1665 nt7.38□□□□□ -1.23
LRE1P25579 FAF1YIL019W 1041 nt7.38□□□□□ -1.23
LRE1P25579 YMR074CYMR074C 438 nt7.38□□□□□ -1.23
LRE1P25579 RDR1YOR380W 1641 nt7.38□□□□□ -1.23
LRE1P25579 MPH3YJR160C 1809 nt7.37□□□□□ -1.23
LRE1P25579 GNA1YFL017C 480 nt7.37□□□□□ -1.23
LRE1P25579 YKL147CYKL147C 618 nt7.37□□□□□ -1.23
LRE1P25579 YTH1YPR107C 627 nt7.37□□□□□ -1.23
LRE1P25579 CBK1YNL161W 2271 nt7.36□□□□□ -1.23
LRE1P25579 PLB3YOL011W 2061 nt7.36□□□□□ -1.23
LRE1P25579 YOR111WYOR111W 699 nt7.36□□□□□ -1.23
LRE1P25579 PLB2YMR006C 2121 nt7.36□□□□□ -1.23
LRE1P25579 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt7.35□□□□□ -1.23
LRE1P25579 DMC1YER179W 1005 nt7.35□□□□□ -1.23
LRE1P25579 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.35□□□□□ -1.23
LRE1P25579 CIA1YDR267C 993 nt7.34□□□□□ -1.23
LRE1P25579 BIO3YNR058W 1443 nt7.34□□□□□ -1.23
LRE1P25579 HTZ1YOL012C 405 nt7.33□□□□□ -1.24
LRE1P25579 YJL163CYJL163C 1668 nt7.32□□□□□ -1.24
LRE1P25579 APE4YHR113W 1473 nt7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.4 ms