Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTAFRP25105 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTAFRP25105 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTAFRP25105 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms