Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
POLR2AP24928 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLR2AP24928 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR2AP24928 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms