Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNE1P24864 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCNE1P24864 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNE1P24864 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNE1P24864 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNE1P24864 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNE1P24864 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNE1P24864 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNE1P24864 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNE1P24864 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNE1P24864 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNE1P24864 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNE1P24864 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNE1P24864 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNE1P24864 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNE1P24864 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNE1P24864 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNE1P24864 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms