Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMA2P24043 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMA2P24043 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMA2P24043 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA2P24043 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA2P24043 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA2P24043 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA2P24043 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA2P24043 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA2P24043 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA2P24043 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA2P24043 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAMA2P24043 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA2P24043 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LAMA2P24043 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA2P24043 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA2P24043 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA2P24043 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA2P24043 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA2P24043 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA2P24043 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LAMA2P24043 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA2P24043 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA2P24043 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA2P24043 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA2P24043 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA2P24043 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA2P24043 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LAMA2P24043 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA2P24043 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA2P24043 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LAMA2P24043 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LAMA2P24043 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms