Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4BP23588 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4BP23588 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF4BP23588 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4BP23588 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EIF4BP23588 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF4BP23588 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF4BP23588 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4BP23588 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4BP23588 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4BP23588 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4BP23588 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.55■■■□□ 2
EIF4BP23588 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms