Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MYF6P23409 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYF6P23409 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYF6P23409 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYF6P23409 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYF6P23409 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYF6P23409 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYF6P23409 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYF6P23409 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYF6P23409 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYF6P23409 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYF6P23409 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYF6P23409 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MYF6P23409 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYF6P23409 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYF6P23409 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MYF6P23409 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYF6P23409 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYF6P23409 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYF6P23409 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYF6P23409 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYF6P23409 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYF6P23409 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYF6P23409 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYF6P23409 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYF6P23409 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYF6P23409 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYF6P23409 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYF6P23409 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYF6P23409 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYF6P23409 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYF6P23409 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYF6P23409 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYF6P23409 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF6P23409 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF6P23409 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF6P23409 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF6P23409 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF6P23409 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF6P23409 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF6P23409 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF6P23409 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF6P23409 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYF6P23409 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYF6P23409 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYF6P23409 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYF6P23409 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYF6P23409 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYF6P23409 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYF6P23409 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MYF6P23409 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYF6P23409 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYF6P23409 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYF6P23409 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYF6P23409 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYF6P23409 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MYF6P23409 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF6P23409 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF6P23409 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF6P23409 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF6P23409 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF6P23409 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYF6P23409 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYF6P23409 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYF6P23409 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYF6P23409 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYF6P23409 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYF6P23409 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYF6P23409 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYF6P23409 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYF6P23409 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYF6P23409 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYF6P23409 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYF6P23409 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYF6P23409 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MYF6P23409 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYF6P23409 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYF6P23409 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYF6P23409 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYF6P23409 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYF6P23409 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYF6P23409 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYF6P23409 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYF6P23409 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYF6P23409 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYF6P23409 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYF6P23409 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYF6P23409 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYF6P23409 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYF6P23409 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYF6P23409 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYF6P23409 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYF6P23409 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYF6P23409 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYF6P23409 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYF6P23409 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYF6P23409 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYF6P23409 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MYF6P23409 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYF6P23409 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms