Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCEA1P23193 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEA1P23193 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms